D-loop haplotype diversity in Brazilian horse breeds

Abstract The first horses were brought to Brazil by the colonizers after 1534. Over the centuries, these animals evolved and adapted to local environmental conditions usually unsuitable for exotic breeds, thereby originating locally adapted Brazilian breeds. The present work represents the first description of maternal genetic diversity in these horse breeds based on D-loop sequences. A D-Loop HSV-I fragment of 252 bp, from 141 horses belonging to ten Brazilian breeds / genetic groups (locally adapted and specialized breeds) were analysed. Thirty-five different haplotypes belonging to 18 haplogroups were identified with 33 polymorphic sites. Haplotype diversity (varying from 0.20 to 0.96) and nucleotide diversity (varying from 0.0039 to 0.0239) was lower for locally adapted than for specialized breeds, with the same pattern observed for FST values. Haplogroups identified in Brazilian breeds are in agreement with previous findings in South American samples. The low variability observed mainly in locally adapted breeds, indicates that, to ensure conservation of these breeds, careful reproductive management is needed. Additional genetic characterization studies are required to support accurate decision-making.

Isolation and characterization of mesenchymal stem cells derived from bovine Wharton's jelly and their potential for use in cloning by nuclear transfer / Isolamento e caracterização de células tronco mesenquimais derivadas de geléia de Wharton bovina e seu potencial para uso na clonagem por transferência nuclear

ABSTRACT: Wharton's jelly is a source of mesenchymal stem cells (MSCs) that had not yet been tested for bovine embryo production by nuclear transfer (NT). Thus, the objective of this study was to isolate, characterize and test MSCs derived from Wharton's jelly for embryo and pregnancy production by NT in cattle. The umbilical cord was collected during calving and cells derived from Wharton's jelly (WJCs) were isolated by explant and cultured in Dulbecco's Modified Eagle Medium. Skin Fibroblasts (FB) were isolated after 6 months of life. Morphological analysis was performed by bright field and scanning electron microscopy (SEM) during cell culture. Phenotypic and genotypic characterization by flow cytometry, immunocytochemistry, RT-PCR and differentiation induction in cell lineages were performed for WJC. In the NT procedure, oocytes at the arrested metaphase II stage were enucleated using micromanipulators, fused with WJCs or FB and later activated artificially. SEM micrographs revealed that WJCs have variable shape under culture. Mesenchymal markers of MSCs (CD29+, CD73+, CD90+ and CD105+) were expressed in bovine-derived WJC cultures, as evidenced by flow cytometry, immunocytochemistry and RT-PCR. When induced, these cells differentiated into osteocytes, chondrocytes and adipocytes. After classification, the WJCs were used in NT. Blastocyst formation rate by NT with WJCs at day 7 was 25.80±0.03%, similar to blatocyst rate with NT using skin fibroblasts (19.00±0.07%). Pregnancies were obtained and showed that WJCs constitute a new cell type for use in animal cloning.

RESUMO: A geleia de Wharton é uma fonte de células tronco mesenquimais (CTMs) que ainda não havia sido testada para a produção de embriões bovinos por transferência nuclear (TN). O objetivo deste estudo foi isolar, caracterizar e testar as CTMs derivadas da geleia de Wharton para produção de embriões e gestações por transferência nuclear em bovinos. O cordão umbilical foi coletado durante o nascimento e as células derivadas da geleia de Wharton (CGWs) foram isoladas por explante e cultivadas em Dulbecco's Modified Eagle Medium. Fibroblastos (FB) da pele foram isolados após 6 meses de vida. As análises morfológicas foram realizadas pelas microscopias de campo claro e eletrônica de varredura durante o cultivo celular. Caracterização fenotípica e genotípica por citometria de fluxo, imunocitoquímica, RT-PCR e indução da diferenciação em linhagens celulares foi realizada com as CGWs. No procedimento de TN, ovócitos no estágio de metáfase II foram enucleados usando micromanipuladores, fusionados com CGWs ou FB e então ativados artificialmente. Micrografias de microscopia de varredura revelaram que CGWs tiveram forma variada sob cultivo. Os marcadores mesenquimais de CTMs (CD29+, CD73+, CD90+ and CD105+) foram expressos em cultura de CGWs bovina, como evidenciado por citometria de fluxo, imunocitoquímica e RT-PCR. Quando induzidas, estas células diferenciaram-se em osteócitos, condrócitos e adipócitos. Após classificação, as CGWs foram utilizadas na TN. A taxa de formação de blastocistos por TN com CGWs no sétimo dia de cultivo foi de 25,80±0,03%, similar a produção de blastócitos por TN com fibroblastos de pele (19,00±0,07). Gestações foram obtidas e mostraram que CGWs constituem um novo tipo celular para ser usado na clonagem animal.

Competitiveness levels in cattle herd farms / Competitividade em propriedades com criação de bovinos

The aim of this experiment was to identify improvement demands for farms with different levels of competitiveness in the west of Rio Grande do Sul state, Brazil. A total of 63 owners of large farms were interviewed (farms with an area greater than 900ha) by applying a semi-structured questionnaire, guided by four drivers: technology (TEC), management (MAN), market relations (MR) and the institutional environment (IE).It was used the Statistical Analysis System 9.2 software to perform the cluster analysis and identify farmers' characteristics. Three random clusters with different levels of competitiveness were observed: low competitiveness level (LCL), middle competitiveness level (MCL) and high competitiveness level (HCL). The 29 variables (sub factors) were evaluated in the cluster analysis according to level of impact on competitiveness, being classified into variables of high, medium or low impact. Stratification was carried out, ranking demands for improvements from aspects attributed by experts in relation to sub factors. The farmers with low competitiveness level (LTL) had an unfavorable status for MAN, while the farmers belonging to clusters MCL and HCL have, respectively, favorable and neutral status for the same driver. The management characteristics determined the level of competitiveness of the farms surveyed.

O objetivo deste experimento é a identificação das demandas de melhorias para fazendas com diferentes níveis de competitividade no Oeste do RS. Entrevistaram-se 63 produtores grandes (área= +900 ha) por meio de um questionário semi-estruturado, dividido em quatro direcionadores: tecnologia (TEC), gestão (MAN), relações de mercado (MR) e ambiente institucional (IE). Utilizou-se o software SAS 2002, versão 9.0, para realização da análise de cluster, realizando a tipologia dos produtores. Nesta análise, formaram-se aleatoriamente três clusters, sendo denominados de baixo nível de competitividade (LCL), médio nível de competitividade (MCL) e alto nível de competitividade (HCL). Dividiram-se as 29 variáveis (subfatores) avaliadas na análise de cluster de acordo com nível de impacto na competitividade das fazendas de bovinos de corte, sendo classificadas em variáveis de alto, médio ou baixo impacto. Esta estratificação do ranking de demanda de melhorias foi realizada a partir dos pesos atribuídos pelos especialistas aos subfatores. Os pecuaristas com baixo nível de competitividade apresentaram status desfavorável para MAN, enquanto os pecuaristas pertencentes aos clusters MCL e HCL apresentaram, respectivamente, status neutro e favorável para o mesmo direcionador. Portanto, a gestão é determinante para definir o nível de competitividade das fazendas entrevistadas.

Distribution of goat breeds in brazil and their relationship with environmental controls / Distribuição de raças de caprinos no brasil e sua relação com controles ambientais

A localização de todos os rebanhos de cabras de raça pura no Brasil foi espacializada de acordo com os controles climáticos (Índice de Temperatura e Umidade, precipitação, topografia, umidade relativa do ar) e controles ambientais (altitude, tipo de pastagem). Os dados foram analisados através de uma análise de regressão, variância, logistica e cluster. Matrizes de distância foram construídas de acordo com a longitude/ latitude e os controles ambientais foram correlacionados por meio do teste de Mantel. O ponto médio para a maioria das raças foi encontrado no estado da Bahia, mas no estado de Pernambuco encontraram-se os pontos médias das raças localmente adaptadas. A Anglonubiana foi a raça comercial com o ponto médio mais ao norte, enquanto as raças Toggenburg, Saanen e Alpina tiveram o ponto médio de produção mais ao sul do país. Houve pouca diferença entre os controles ambientais para as raças localamente adaptadas e comerciais, mas raças dupla aptidão encontraram-se nas regiões com menor precipitação e Índice de Desenvolvimento Humano , mas com as temperaturas e área de mata mais elevadas . As raças comerciais são mais difundidas no Brasil do que raças locais, sendo que as últimas ocorrem um maior risco de extinção devido a doenças, seca ou cruzamento com outras raças.

The localization of all flocks of purebred goats in Brazil was spatialized in ARCGIS along with climatic (THI, precipitation, topography, relative humidity) and physical environmental controls (altitude, pasture type). Data were analysed using analysis of variance, logisitic regression and cluster analyses. Distance matrices were constructed using longitude/latitude and those from environmental controls and these were correlated using Mantel test. Midpoint for most breeds was in Bahia State, but in Pernambuco for locally adapted breeds. The Anglonubian was the commercial breed with the northernmost midpoint. Toggenburg, Saanen and Apline breeds had the southernmost midpoint. There was little difference between environmental controls for locally adapted and commercial breeds, but dual purpose breeds were in regions with lower rainfall and HDI but higher temperatures and shrubland. Commercial herds are more widespread in Brazil than local breeds putting the latter at higher risk of extinction through drought, disease or crossing with other breeds.

Effect of alternate and simultaneous grazing on endoparasite infection in sheep and cattle / Efeitos do pastejo alternado e simultâneo sobre a infecção de endoparasitas em ovinos e bovinos

This experiment was carried out on 8 ha of Panicum maximum cv. Tanzania pastures, with rotational grazing consisting of 7 days of occupation and 21 days of rest. Four treatments were evaluated: cattle grazing alone (BOV), sheep grazing alone (OVI), cattle and sheep grazing simultaneously (SIM) and cattle grazing followed by sheep (alternate - ALT). Twenty heifers and 30 male Santa Inês lambs were used. Fecal egg count (FEC) and fecal cultures were carried out. Blood was also collected to examine red and white cell series, total plasma protein (TPP), albumin and hemoglobin. FEC and estimated nematode pathogenicity index in sheep were lower in the SIM treatment. The Haemonchus spp. proportion was higher in isolated grazing systems. For sheep, mixed grazing was shown to reduce endoparasite infection, and SIM was better than ALT. For cattle, no difference between grazing systems was seen. Therefore, simultaneous grazing (sheep and cattle) may be a tool for reducing the need for anthelmintic treatments in sheep.

O experimento foi realizado em 8ha de pasto de Panicum maximum cv. Tanzania, com pastejo rotacionado de 7 dias de ocupação e 21 dias de descanso. Quatro tratamentos foram avaliados: bovinos pastejando isoladamente (BOV), ovinos pastejando isoladamente (OVI), bovinos e ovinos pastejando simultaneamente (SIM), e bovinos pastejando previamente aos ovinos (alternado - ALT). Vinte novilhas e 30 cordeiros Santa Inês foram utilizados. Contagem de ovos nas fezes (FEC) e coproculturas foram realizados. Sangue também foi colhido para examinar a série vermelha e branca, proteínas plasmáticas totais (TPP), albumina e hemoglobina. FEC e índice de patogenicidade estimada de nematoides nos ovinos foram menores no tratamento SIM. A proporção de Haemonchus spp. foi maior nos sistemas isolados de pastejo. Para os ovinos, os sistemas consorciados apresentaram redução na infecção endoparasitária, sendo SIM melhor que ALT. Para os bovinos, nenhuma diferença entre os sistemas de pastejo foi verificado. Entretanto, o pastejo simultâneo (ovinos e bovinos) pode ser uma ferramenta para reduzir a necessidade de tratamentos anti-helmínticos em ovinos.

Determination of metabolizable energy value of corn with different average geometric diameters for european quails (Coturnix coturnix coturnix)

Metabolizable energy (ME) of corn with different geometric diameters was determined in European quail with 26 days of age with 124 g of mean live weight, using the Total Collection of Excreta Method. One hundred and twenty five quails were divided in five treatments, five replications with five quails each, with one treatment used to determine endogenous losses. Values of Average Geometric Diameter (AGD) of the corn were 600, 800, 1000 and 1200 µm. ME of corn was not affected by AGD. Average values were 3079, 3274, 3300, 3137 Kcal/kg respectively for apparent metabolizable energy, corrected apparent metabolizable energy, true metabolizable energy, corrected true metabolizable energy.

Determinou-se o valor de energia metabolizável (EM) do milho com diferentes diâmetros geométrico médio em codornas com 26 dias de idade e 124 g de peso médio, utilizando-se a metodologia da coleta total de excretas. Foram utilizadas 125 codornas distribuídas em cinco tratamentos com cinco repetições de cinco aves, sendo um tratamento para determinar as perdas endógenas. Os valores de diâmetro geométrico médio (DGM) do milho estudado foram 600, 800, 1000 e 1200 µm. O DGM não apresentou influência significativa sobre a EM do milho que apresentou valores médios de 3079, 3274, 3300, verdadeira, energia metabolizável verdadeira corrigida.

Body indices for the pantaneiro horse / Índices corporais para o cavalo pantaneiro

Body index measurements on 2248 horses registered by the Brazilian Association of Pantaneiro Horse Breeders (ABCCP), in the period from 1972 to 2000 were analyzed. Data was analyzed using SAS and DFREML to calculate genetic parameters. The Dactyl Thoracic Index indicated that these animals are intermediary (not light horses but not suitable for traction), while the BARON and CREVAT index confirmed this result. The Chest Index presented animals that are good for speed as they have long legs but looking at the Body index the indication was that these horses are neither suitable for speed nor traction (intermediary). The analysis of other conformation indices indicated that, in general, these horses are medilines, show good speed and chest development, making them suitable for dealing with cattle and resistance for long treks. The environmental factor analysis verified that these horses have changed in recent years possibly due to selection by the breeder which may affect their adaptive capacity.

Foram estudados índices zootécnicos de 2.248 animais registrados na Associação Brasileira de Criadores do Cavalo Pantaneiro (ABCCP), no período compreendido entre 1972 e 2000. Os dados foram analisados usando o programa SAS e o DFREML para estimação de parâmetros genéticos. Na análise dos índices corporais, o índice dáctilo torácico (IDT) apresentou animais intermediários (nem leves e nem aptos para tração). O índice de BARON e CREVAT também confirmou este resultado. Na determinação do índice peitoral (IP), os animais foram considerados, em geral, favoráveis à velocidade por apresentarem membros longos. Já no índice corporal (IC), a maioria dos animais não foi apta à velocidade e nem à tração (mediolíneos). Através da análise dos índices de conformação verificou-se que, em geral, os Pantaneiros são mediolíneos, aptos para velocidade e possuem bom desenvolvimento torácico, proporcionando velocidade na lida do gado e resistência a longas caminhadas. Na análise dos fatores ambientais, verificou-se que nos últimos anos alguns índices têm sofrido alterações, provavelmente devido à seleção já exercida pelo criador, que pode afetar a capacidade de adaptação dos cavalos.